携带同型纯合子的重症联合免疫缺陷突变（Prkdcscid，通常称为scid）的小鼠缺乏功能性T细胞和B细胞，并且血液中淋巴细胞减少，丙种球蛋白减少，但造血微环境是正常的。大多数的SCID鼠检测不到IgM, IgG1, IgG2a, IgG2b, IgG3, 或IgA。胸腺、淋巴结和脾脏的滤泡中实际上缺乏淋巴细胞。SCID小鼠可以接受同种或异种移植物，使它成为细胞转输实验的良好的模型动物。一些SCID小鼠会自发发生部分免疫反应，SCID小鼠血清Ig水平高于1ug/ml被称为“leaky”。通过将SCID突变导入到不同的小鼠中，可以产生不同基因背景的SCID小鼠。如C57BL/6，BALB/cBy，C3H/He背景的SCID小鼠，以及NOD/ShiLtSz背景的NOD-SCID小鼠等。